- Czy w ramach genomowej oceny wartości hodowlanej bydła przyjmowane będą dane z genotypami zwierząt (niezależnie od źródła – laboratoria w Polsce, wymiany bilateralne) po NIEPRZEKRACZALNYM terminie przedstawionym w harmonogramie oceny?
Nie, ponieważ każde opóźnienie praca w złożonym procesie oceny skutkuje niedostarczeniem na czas danych do kolejnych etapów obliczeń wh. Działania podejmowane przez pracowników Instytutu i jednostek współpracujących w trybie produkcyjnym kierowane są dla wszystkich odbiorców oceny w tym hodowców i spółek inseminacyjnych i innych podmiotów, a nie dla „spóźnialskich”. - Czy istnieje zbiorczy dokument z metodologią oceny wartości hodowlanej dla buhajów rasy PHF odmiany czarno-białej i czerwono-białej ocenianych konwencjonalnie i genomowo w Polsce?
Tak, podobnie jak na stwonie wycena.izoo.krakow.pl zbiorczy dokument „Ocena wartości hodowlanej buhajów rasy PHF odmiany czarno-białej i czerwono-białej. kwiecień 2021 można znaleść pod adresem. - Co oznacza EBV, MACE, GPI i GMACE?
W celu odróżnienia rodzajów ocen prowadzono specjalne kody opisujące, dla każdej cechy, typ opublikowanej wartości hodowlanej:
– EBV – krajowa konwencjonalna wartość hodowlana,
– MACE – międzynarodowa konwencjonalna wartość hodowlana,
– GPI – krajowa genomowa wartość hodowlana,
– GMACE – międzynarodowa genomowa wartość hodowlana. - W moich ocenach znalazłem zwierzęta które są ocenione zarówno konwencjonalnie jak i genomowo? Z czego to wynika?
Generalnie zwierzęta oceniane genomowo uzyskują wartość hodowlaną tylko z zakresu GPI oraz GMACE. Podobna sytuacja ma miejsce w przypadku EBV oraz MACE dla zwierząt ocenionych w systemie konwencjonalnym. Miemniej istnieje możliwość, że dla cech ocenianych tylko w Polsce, niebędących objętych międzynarodową oceną Interbull buhaje otrzymują oceny mieszane (kombinowane). Ma to na przykład miejsce w przypadku cechy – kaliber.
- Jak wykorzystać wyniki oceny wartości hodowlanej dla przebiegu porodów oraz przeżywalność cieląt?
Przebieg porodu cielęcia jest związany z genetycznym, bezpośrednim wpływem jego ojca (efekt PPB). Ocena wartości hodowlanej buhaja dla tej cechy większa od 100 oznacza więc łatwiejszy poród u krów inseminowanych jego nasieniem. Z tego powodu, do inseminacji jałówek, w celu ułatwienia porodu, zaleca się wybór buhajów o wartości hodowlanej dla efektu bezpośredniego wnoszącej 110 lub powyżej. Należy jednak brać pod uwagę fakt, że w przyszłości u łatwo urodzonych córek buhaja o wysokiej bezpośredniej ocenie wartości hodowlanej, pogorszy się przebieg ocieleń, ze względu na odziedziczone po ojcu cechy budowy. Z tego powodu rekomenduje się wybór buhajów z wysoką oceną bezpośredniej wartości hodowlanej (PPB) do krycia jałówek. Natomiast do krycia starszych krów zaleca się wybór buhajów z wysoką matczyną wartością hodowlaną (PPM), co zapewni osiągnięcie postępu hodowlanego w tym zakresie. Podobne zalecenia dotyczą śmiertelności okołoporodowej cieląt (PCB, PCM) ze względu na korelacje genetyczne tej cechy z przebiegiem porodu. - Jaka jest metoda imputacji genotypów niskiej gęstości?
Genotypy imputowane są przy wykorzystaniu oprogramowania FImpute (Sargolzaei i wsp. 2014) wobec mapy ARS-UCD 1.2 genomu bydła do genotypów wysokiej gęstości (ponad 54 tysiące SNP).