{"id":212,"date":"2020-07-23T11:59:18","date_gmt":"2020-07-23T11:59:18","guid":{"rendered":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/?post_type=docs&p=212"},"modified":"2025-02-13T11:48:04","modified_gmt":"2025-02-13T11:48:04","slug":"metodologia-badan-oraz-zasady-publikacji","status":"publish","type":"docs","link":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/docs\/metodologia-badan-oraz-zasady-publikacji\/","title":{"rendered":"Metodologia bada\u0144 oraz zasady publikacji"},"content":{"rendered":"\n

Metodologia bada\u0144 zwi\u0105zanych z ustaleniem profilu cech genetycznych (cech wp\u0142ywaj\u0105cych na hodowl\u0119, mleczno\u015b\u0107, umaszczenie oraz defekt\u00f3w genetycznych) zosta\u0142a opracowana na podstawie wsp\u00f3lnych bada\u0144 oraz \u015bcis\u0142ej wsp\u00f3\u0142pracy Instytutu Zootechniki Pa\u0144stwowego Instytutu Badawczego z Laboratorium genetyki byd\u0142a Polskiej Federacji Hodowc\u00f3w Byd\u0142a i\u00a0Producent\u00f3w Mleka oraz europejskiej Sp\u00f3\u0142dzielni EuroGenomics.<\/p>\n\n\n\n

W przypadku cech dziedziczonych jednogenowo mo\u017cliwe jest odczytanie definiuj\u0105cego je wariantu (allelu) wyra\u017conego poprzez odpowiednie nukleotydy, a co za tym idzie odczytanie mutacji przyczynowej, wp\u0142ywaj\u0105cej na kszta\u0142towanie danej cechy genetycznej. W wi\u0119kszo\u015bci przypadk\u00f3w (mi\u0119dzy innymi BLAD, DUMPS czy HH1) wystarczy odczyta\u0107 jeden marker typu SNP by zdefiniowa\u0107 charakter danej cechy genetycznej. W innych przypadkach (RED FACTOR oraz KAPPA KAZEINA) na zdefiniowanie okre\u015blonego genu potrzebne jest kilka marker\u00f3w typu SNP.<\/p>\n\n\n\n

W badaniach wykorzystano specjalny zestaw sond (marker\u00f3w SNP) charakterystyczny dla danej cechy genetycznej (syndromu chorobowego, cechy wp\u0142ywaj\u0105cej na hodowl\u0119, umaszczenie czy mleczno\u015b\u0107). O dob\u00f3r odpowiednich sond, ich umieszczenie na mikromacierzy SNP oraz walidacj\u0119 dba specjalnie w tym celu powo\u0142ana grupa robocza Sp\u00f3\u0142dzielni EuroGenomics. Taki unikalny zestaw sond, b\u0119d\u0105cy wynikiem wsp\u00f3\u0142pracy naukowc\u00f3w wsp\u00f3\u0142pracuj\u0105cych z EuroGenomics, zosta\u0142 umieszczony na mikromacierzy EuroG MD<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Odczyt genotypu SNP nast\u0119puje bezpo\u015brednio z mikromacierzy SNP (test bezpo\u015bredni) zdeponowanego w bazie genotyp\u00f3w Instytutu Zootechniki Pa\u0144stwowego Instytutu Badawczego b\u0105d\u017a te\u017c mo\u017ce zosta\u0107 imputowany (test po\u015bredni) w procesie przygotowywania danych genomowych dla ka\u017cdego osobnika. Informacje o rodzaju testu umieszczone s\u0105 r\u00f3wnie\u017c na Karcie cech genetycznych<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/figure>\n\n\n\n

W portalu publikowane s\u0105 wyniki odczytu cech genetycznych wraz z ich interpretacj\u0105 dla zwierz\u0105t, kt\u00f3re zosta\u0142y wys\u0142ane pierwszy raz (nie uwzgl\u0119dniane s\u0105 uaktualnienia oceny) do genomowej oceny warto\u015bci hodowlanej od roku 2020.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Metodologia bada\u0144 zwi\u0105zanych z ustaleniem profilu cech genetycznych (cech wp\u0142ywaj\u0105cych na hodowl\u0119, mleczno\u015b\u0107, umaszczenie oraz defekt\u00f3w genetycznych) zosta\u0142a opracowana na podstawie wsp\u00f3lnych bada\u0144 oraz \u015bcis\u0142ej wsp\u00f3\u0142pracy Instytutu Zootechniki Pa\u0144stwowego Instytutu […]<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"parent":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"doc_category":[15],"doc_tag":[18,7],"class_list":["post-212","docs","type-docs","status-publish","hentry","doc_category-cechy-genetyczne","doc_tag-cecha-genetyczna","doc_tag-snp"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/docs\/212","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/docs"}],"about":[{"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/types\/docs"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=212"}],"version-history":[{"count":12,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/docs\/212\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1813,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/docs\/212\/revisions\/1813"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=212"}],"wp:term":[{"taxonomy":"doc_category","embeddable":true,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/doc_category?post=212"},{"taxonomy":"doc_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/crs.izoo.krakow.pl\/wiki\/wp-json\/wp\/v2\/doc_tag?post=212"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}